Glossario

Southern blot

Il Southern blot, il cui nome deriva dal ricercatore che l'ha inventata (E. N. Southern), è una metodica che permette di identificare la presenza di una determinata sequenza genica all'interno del genoma di un organismo.

Questo è possibile tagliando il DNA genomico con appositi enzimi, gli enzimi di restrizione, e facendolo migrare su un gel che permetta la separazione dei vari frammenti per dimensione.

A questo punto si trasferisce il DNA per capillarità su un filtro di nylon, sul quale il DNA aderisce in maniera salda.

Infine si mette a contatto questo filtro con una sonda, cioè un frammento di DNA specifico per la sequenza ricercata e marcato radioattivamente.

A questo punto si adagia una pellicola fotografica sul filtro, e se nel genoma era presente la sequenza di interesse, questa verrà impressionata in un punto preciso dalla radioattività derivante dalla sonda che si è legata al DNA complementare del campione.

Il risultato sarà la presenza di una banda scura sulla pellicola fotografica.

Questa tecnica trova moltissime applicazioni sia nella diagnostica molecolare di malattie che nella ricerca di base.

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