Il codone è una tripletta di nucleotidi lungo la sequenza di un mRNA che codifica per uno specifico aminoacido.
Il codone d'inizio (start codon) è il codone che specifica il primo aminoacido di un polipeptide. In genere si tratta del codone AUG codificante per l'aminoacido metionina sia negli organismi procarioti che negli eucarioti.
Per codone di terminazione (stop codon) si intende invece ciascuno dei tre codoni di stop della traduzione (UAA, UGA, UAG) per i quali non esiste il corrispondente tRNA: in corrispondenza di questi codoni il peptide si stacca dal ribosoma che lo stava sintetizzando indicando l'avvenuta traduzione della catena proteica codificata dall' mRNA.