Si chiama allele ciascuna delle forme alternative in cui può comparire un gene.
L'allele più frequente in una popolazione viene definito
La presenza di alleli alternativi viene definita polimorfismo e può essere utile per la caratterizzazione genetica degli individui, per esempio in medicina legale o in criminologia. Altri alleli, fortunatamente più rari, possono avere un significato patologico, in quanto recanti mutazioni causa di malattie ereditarie.
Ogni genomaeucariota comprende un allele di origine materna e uno di origine paterna per ciascun gene: l'individuo portatore di due copie di uno stesso allele è detto