Il microscopio stereoscopico è un microscopio che permette ingrandimenti bassi, si possono vedere oggetti tridimensionali e permette quindi la manipolazione per la microchirurgia, come il prelievo degli oociti dalle ampolle ovariche.
Per consentire una visione stereoscopica sono presenti due oculari, e oltre alla visione con luce trasmessa è possibile utilizzare un'illuminaizione derivante da fibre ottiche.
Questo microscopio permette l'agevole manipolazione degli oociti, che si effettua tramite capillare di vetro tirati a fuoco.
Applicando delle lievi suzioni al capillare è possibile aspirare gli oociti all'interno del capillare, una lieve pressione serve per emetterli nel terreno di coltura.