Il punteggio LOD è una valutazione statistica della probabilità che due loci, cioè le posizioni di due sequenza geniche sui cromosomi, si trovino vicini e sullo stesso cromosoma.
Un punteggio di LOD elevato, pari a tre o superiore, indica che i loci in cui sono situate le due sequenze non solo sono situati sullo stesso cromosoma, ma sono anche talmente vicini che verranno ereditati insieme dalle generazioni successive, in quando è improbabile che vengano separati da un evento di ricombinazione, il processo in cui i cromosomi durante la meiosi si scambiano dei frammenti per assicurare un nuovo assortimento genico, importante per la variabilità genetica.
