La metafase è la fase della mitosi, il processo di divisione cellulare, in cui i cromosomi si posizionano in maniera ordinata lungo l'asse centrale della cellula.
In questa particolare fase i cromosomi sono estremamente condensati e facili da studiare, pertanto nella ricerca delle alterazioni cromosomiche, si ferma la divisione cellulare in questa fase con apposite sostanze che distruggono il fuso mitotico, come per esempio la colchicina, e impediscono pertanto il proseguire della divisione.
Da cellule così trattate si ottengono dei cromosomi ben formati che possono essere utilizzati per l'analisi del cariotipo, per l'identificazione di traslocazioni e per la mappatura cromosomica, cioè lo studio che permette di individuare la localizzazione di determinati geni sui cromosomi.