I cromosomi sessuali sono i cromosomi che contengono i geni che stabiliscono il sesso di un individuo.
Nell'uomo sono presenti due tipi di cromosomi sessuali, il cromosoma X e il cromosoma Y. I maschi possiedono un cromosoma X e un cromosoma Y, mentre le femmine possiedono due cromosomi X.
Non è così per tutte le specie animali, infatti per gli uccelli la situazione è esattamente ribaltata: due cromosomi X per il sesso maschile, e un cromosoma X e un cromosoma Y per il sesso femminile.