Per coppia di basi si intendono due basi che nella doppia elica del DNA si trovano affacciate e legate in modo complementare in modo da formare uno dei pioli della "scala a chiocciola" del DNA.
Le basi del DNA sono l'adenina, la timina, la guanina, e la citosina indicate rispettivamente nel codice genetico con le lettere A, T, G e C.
Le coppie di basi possibili sono solo due, in quanto l'adenina può associasi solo con la timina e viceversa, e la stessa cosa vale per guanina e citosina.
