La Scuola di Bioinformatica, che vanta un’esperienza più che decennale, si rivolge a ricercatori, tecnici, dottorandi e laureati in discipline scientifiche dei corsi di laurea magistrale delle Classi di Biologia, Chimica, Medicina, Professioni Sanitarie, Biotecnologie e Farmacia interessati ad affrontare le problematiche di utilizzo della bioinformatica. Ogni edizione di ciascun corso è a numero chiuso poiché le lezioni si tengono in aula informatica dove si svolgono anche le esercitazioni pratiche.
I corsi 2013 vengono tenuti in inglese e italiano.
Nel 2013 la Scuola si è trasferita, i corsi si svolgono presso: Aula informatica Università dell’Insubria a Busto Arsizio, via Alberto da Giussano 12, con orario: 10-17
La struttura complessiva della scuola è la seguente:
· Statistica per il laboratorio - 19-20-21 Giugno 2013
Riccardo Fesce, Università dell’Insubria
La statistica rappresenta uno strumento fondamentale per la progettazione e lo sviluppo di studi scientifici e per l'analisi dei dati da essi ottenuti. Con l'utilizzo sempre più diffuso di tecnologie high-throughput, la quantità di dati analizzabili è cresciuta in maniera considerevole e compito degli analisti è di adattare concetti già presenti e, dove necessario, svilupparne di nuovi per far fronte alle diverse domande che il mondo scientifico sta ponendo. In questo corso, insieme con un'introduzione mirata ai principali concetti di probablitità e statistica, verrà fornita una panoramica dei piu' importanti sviluppi nell'analisi di test multipli con esercitazioni pratiche al calcolatore.
Prerequisiti: Conoscenze di matematica a livello di liceo scientifico e di biologia molecolare a livello universitario. Offerta formativa: 9 ore teoria + 9 ore pratica
· Bioinformatics approach (entry level) - 25-26 Giugno 2013
Andrew Cowley, EBI European Bioinformatics Institute, UK; Tiziana Alberio, Università dell’Insubria
This course is aimed at researchers across Italy who wish to develop their understanding on the data resources and tools available from public databases. The programme provides an overview of commonly used public resources for the analysis of nucleotide and protein sequences. Delegates will learn about these data resources in short lectures and then gain hands-on experience in using them to analyse data. The practical exercises use web-browser-based tools and assume no previous training in bioinformatics programming.
Skills: general knowledge on physics, chemistry and biology, no previous training in bioinformatics is required
Training offer: 6 hours lecturing + 6 hours practical training
· ANALISI BIOINFORMATICA DI SEQUENZE (filogenetica) E DI STRUTTURE (PDB, visualizzazione, swissmodel) - 27-28 giugno 2013 Laura Emery, EBI European Bioinformatics Institute, UK; Mauro Fasano, Università dell’Insubria
Le principali banche dati pubbliche contengono oggi una enorme quantità di informazioni sulla struttura e la funzione dei geni di moltissimi organismi. I principali programmi di bioinformatica rappresentano uno strumento fondamentale per poter utilizzare efficientemente queste informazioni a fini di ricerca. Questo corso è dedicato soprattutto a coloro che, per scopi di ricerca, debbano utilizzare strumenti di tipo bioinformatico. Il corso si propone di fornire i principi teorici fondamentali per capire il funzionamento dei principali algoritmi, e per poterne sfruttare tutte le potenzialità. In particolare, si illustrerà a diversi livelli, come il principio della conservazione filogenetica può essere utilizzato per formulare ipotesi sperimentalmente testabili su sequenze proteiche parzialmente caratterizzate o completamente non caratterizzate provenienti da diverse specie. Verrà dato ampio spazio ad esercitazioni pratiche su casi reali e i partecipanti sono incoraggiati a proporre sequenze di loro interesse.
Prerequisiti: Conoscenze di fisica, chimica e biologia molecolare a livello universitario, conoscenza dei
principali database biologici.
Offerta formativa: 6 ore teoria + 6 ore pratica
· INTRODUZIONE ALLA SYSTEMS BIOLOGY (trascrittomica, proteomica, principi metodologici,analisi statistica) - 1-4 Luglio 2013
Tiziana Alberio, Mauro Fasano, Riccardo Fesce, Università dell’Insubria; Annalisa Barla, Salvatore Masecchia,
Università di Genova.
Il corso si propone di introdurre alcune tipologie di dati sperimentali “high-throughput” e i metodi di analisi utilizzati nella loro analisi per affrontare le principali questioni della biologia molecolare nell'era postgenomica: l'annotazione funzionale del genoma e la ricostruzione del network di interazioni regolatrici tra geni. Il corso è rivolto sia ai ricercatori che si trovano oggi a dover decidere l’utilizzo di nuovi e potenti strumenti di analisi sperimentale su scala genomica, sia a coloro che si propongono di estrarre dai dati highthroughput già pubblicati, e disponibili in banche dati pubbliche, per ricavare informazioni rilevanti per i problemi biologici di proprio interesse.
Prerequisiti: Biochimica e biologia molecolare a livello universitario. Conoscenza di base della tecnologia
dei microarray e dell'elettroforesi bidimensionale.
Offerta formativa: 12 ore teoria + 12 ore pratica
Per info e iscrizioni: http://www.fobiotech.org/
